癫痫病人经抗痫药物治疗后有70～80%病人能得到满意控制，但剩下的20～30%病人，在应用一种以上一线药物及数种二线药物，且都已达到最大耐受剂量，临床经过仍迁延，频繁发作，影响日常生活者称为难治性癫痫，据英国流行病学统计资料中24%难治性癫痫见于全身型，72%为部分性发作。
难治性癫痫病的治疗方案
（1）药物治疗基本同前，常为第一线药加第二线药，甚至加上第三线药，新药如托吡酯、拉莫三嗪、氨己烯酸、非尔氨酯、唑尼沙胺等。
（2）药物治疗难于控制发作可考虑手术治疗。各种癫痫发作都因脑内有一致痫灶，如能切除此病灶，就有可能使发作停止。在致病灶中有一部分神经细胞容易受激惹而有自发放电，而它的放电又可激发邻近神经细胞放电，这样一传二，二传三的扩散至远处使更多神经细胞放电，当达到一定量放电时就引起一次癫痫发作，而此扩散是按脑内的解剖结构传导的，称为癫痫波的扩散通路。根据以上情况，如能切除致痫灶或阻断痫性放电的传导通路，或损毁脑内癫痫的易化区域或刺激癫痫的抑制区等法，可达到控制癫痫发作目的。
癫痫的外科治疗也不能百分之百的控制癫痫发作，有时也可导致手术失败，需要二次手术治疗。导致癫痫手术失败的原因很多，如：
（1）颅内病变有时为致痫灶的一部分或紧邻致痫灶，由于生理和解剖的限制，致使病变周围致痫灶切除不彻底，此种情况约占颅内病变所致癫痫病人术后需再次手术的23%。
（2） 致痫灶范围广或致痫灶范围难以确定，手术难以彻底切除。
（3）继发性癫痫灶处理不当，致使术后癫痫继续发作，此种情况约占所有再次手术患者的20%～62%。
（4）颞叶癫痫的双重病理改变处理不当，颞叶内侧结构切除范围不够，残存杏仁核过大，只切除一侧病变等，均可导致癫痫发作。
（5）手术创伤、电生理定位错误、临床表现定位错误、手术方式选择错误、术后抗癫痫药物应用不当等也可导致癫痫术后发作。
（6）癫痫诱因作用，癫痫术后患者发生头外伤、过度饮酒、脑炎、高热、相关药物作用、惊吓、过度劳累、遗传易感因素等，均可导致癫痫术后发作。
（7）手术方式认识错误，手术本身就有失败的可能性，如胼胝体切开术癫痫控制改善只有20%～90%不等；迷走神经刺激术治疗癫痫总有效率为50%～70%。
